Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCAN1P53805 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms