Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KPNA2P52292 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KPNA2P52292 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KPNA2P52292 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KPNA2P52292 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KPNA2P52292 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KPNA2P52292 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA2P52292 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms