Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2BP42772 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms