Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP58Q9Y2X3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms