Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMC2Q9NRP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMC2Q9NRP2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms