Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN3Q96S86 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN3Q96S86 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms