Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUBCNQ92622 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms