Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM199Q8N511 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms