Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TSPO2Q5TGU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPO2Q5TGU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms