Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NID2Q14112 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NID2Q14112 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NID2Q14112 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NID2Q14112 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID2Q14112 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID2Q14112 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID2Q14112 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID2Q14112 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID2Q14112 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID2Q14112 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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