Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 SPC105YGL093W 2754 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 SSB1YDL229W 1842 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 MND1YGL183C 660 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PTI1YGR156W 1278 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 ATG27YJL178C 816 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YJR020WYJR020W 333 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 SPN1YPR133C 1233 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 HMG1YML075C 3165 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 MSM1YGR171C 1728 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 MSK1YNL073W 1731 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 ULP1YPL020C 1866 nt4.88□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RSC3YDR303C 2658 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 ERP3YDL018C 678 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RPP1AYDL081C 321 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 GPP2YER062C 753 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 SPI1YER150W 447 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 LOC1YFR001W 615 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YGR114CYGR114C 390 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RPS4BYHR203C 786 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YIL082WYIL082W 873 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RPS4AYJR145C 786 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RLP24YLR009W 600 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YMR087WYMR087W 855 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 TRS20YBR254C 528 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PKP2YGL059W 1476 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RAD54YGL163C 2697 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 LAS1YKR063C 1509 nt4.87□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 CLF1YLR117C 2064 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YPD1YDL235C 504 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 LRS4YDR439W 1044 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PMI40YER003C 1290 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 AML1YGR001C 747 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 EPT1YHR123W 1176 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RSM25YIL093C 795 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 CPR7YJR032W 1182 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 IDI1YPL117C 867 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RPN6YDL097C 1305 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YMR046CYMR046C 1323 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 UBP12YJL197W 3765 nt4.86□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 UTP25YIL091C 2166 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 MTC7YEL033W 420 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YGL214WYGL214W 486 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PXR1YGR280C 816 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PRS3YHL011C 963 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 PAM18YLR008C 507 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 NUP133YKR082W 3474 nt4.85□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 KIN2YLR096W 3444 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YKL075CYKL075C 1353 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 SLF1YDR515W 1344 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YFL019CYFL019C 354 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 MPO1YGL010W 525 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RNR2YJL026W 1200 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 SFT1YKL006C-A 294 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 BET5YML077W 480 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YMR187CYMR187C 1296 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 RLP7YNL002C 969 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 YBR090CYBR090C 369 nt4.84□□□□□ -1.63
SSF2Q12153 DAP2YHR028C 2457 nt4.84□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YCR023CYCR023C 1836 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 TMA17YDL110C 453 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 AIM7YDR063W 450 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 ECM11YDR446W 909 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YFH7YFR007W 1062 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YHR097CYHR097C 1101 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 RGI2YIL057C 495 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 NNF1YJR112W 606 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 MBR1YKL093W 1020 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YPT53YNL093W 663 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YOR364WYOR364W 369 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YDL199CYDL199C 2064 nt4.83□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 TAF8YML114C 1533 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YOR022CYOR022C 2148 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 TIF4632YGL049C 2745 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 CIT1YNR001C 1440 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 GYP6YJL044C 1377 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 IRC18YJL037W 675 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 BUD19YJL188C 309 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 STE18YJR086W 333 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 ERP1YAR002C-A 660 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 GIM5YML094W 492 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 TAP42YMR028W 1101 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 YPL035CYPL035C 348 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 DSS4YPR017C 432 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 TRM44YPL030W 1704 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 NAT1YDL040C 2565 nt4.82□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 VHC1YBR235W 3363 nt4.81□□□□□ -1.64
SSF2Q12153 ERG9YHR190W 1335 nt4.81□□□□□ -1.64
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