Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms