Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE2O96020 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE2O96020 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms