Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KCTD3Q9Y597 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCTD3Q9Y597 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms