Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms