Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNIKQ9UKE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms