Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.9 ms