Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A6Q9P2U8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms