Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms