Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIPEPQ99797 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MIPEPQ99797 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIPEPQ99797 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIPEPQ99797 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIPEPQ99797 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIPEPQ99797 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIPEPQ99797 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MIPEPQ99797 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIPEPQ99797 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MIPEPQ99797 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MIPEPQ99797 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MIPEPQ99797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms