Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms