Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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