Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms