Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH18Q13634 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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