Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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