Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 YPL035CYPL035C 348 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YPL162CYPL162C 822 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YPR077CYPR077C 372 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 PIN3YPR154W 648 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 ATP25YMR098C 1839 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YJR030CYJR030C 2238 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 RAD26YJR035W 3258 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YOR022CYOR022C 2148 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 XRN1YGL173C 4587 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 SLI1YGR212W 1407 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 SPT10YJL127C 1923 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 DET1YDR051C 1005 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 RAD55YDR076W 1221 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 DGA1YOR245C 1257 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YBR137WYBR137W 540 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 KRI1YNL308C 1776 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 SKN7YHR206W 1869 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 TAF1YGR274C 3201 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 MSD1YPL104W 1977 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 SST2YLR452C 2097 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 MDN1YLR106C 14733 nt3.46□□□□□ -1.85
RPN5Q12250 YGR237CYGR237C 2358 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ARI1YGL157W 1044 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PRP18YGR006W 756 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YGR064WYGR064W 369 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YLR416CYLR416C 399 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PEX11YOL147C 711 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PRM4YPL156C 855 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ATG29YPL166W 642 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PTM1YKL039W 1572 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MGT1YDL200C 567 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RPS25AYGR027C 327 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RIF2YLR453C 1188 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 OCA2YNL056W 594 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 snR11snR11 258 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RRP7YCL031C 894 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ATG21YPL100W 1491 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 HRD1YOL013C 1656 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ASI1YMR119W 1875 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MSM1YGR171C 1728 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 VIP1YLR410W 3441 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 NSP1YJL041W 2472 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 VPS17YOR132W 1656 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MRPL11YDL202W 750 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YDR431WYDR431W 312 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YGR126WYGR126W 693 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SKG1YKR100C 1068 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 CPR8YNR028W 927 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 HHF1YBR009C 312 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YBR089WYBR089W 600 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PHO88YBR106W 567 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ICS2YBR157C 768 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SWI1YPL016W 3945 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RRN6YBL014C 2685 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RAD5YLR032W 3510 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PKP2YGL059W 1476 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ITT1YML068W 1395 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YGR168CYGR168C 1131 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PFS1YHR185C 714 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RSF1YMR030W 1131 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 PLP2YOR281C 861 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 CSH1YBR161W 1131 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SEC15YGL233W 2733 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 THR4YCR053W 1545 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 DAN4YJR151C 3486 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 OSH3YHR073W 2991 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MNT4YNR059W 1743 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 AAD3YCR107W 1092 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YDR535CYDR535C 501 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ARG3YJL088W 1017 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RNH203YLR154C 333 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RIM11YMR139W 1113 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ATG34YOL083W 1239 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 FDH2YPL275W 711 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SET1YHR119W 3243 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RRP42YDL111C 798 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 GRX2YDR513W 432 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YFL051CYFL051C 483 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RPL1BYGL135W 654 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SPT4YGR063C 309 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YGR114CYGR114C 390 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MPC3YGR243W 441 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 YIL161WYIL161W 708 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SOD1YJR104C 465 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 SWD2YKL018W 990 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 TMA19YKL056C 504 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 MCT1YOR221C 1083 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RRP36YOR287C 903 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RPL1AYPL220W 654 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 RSF2YJR127C 4143 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 WHI3YNL197C 1986 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ALA1YOR335C 2877 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN5Q12250 ANB1YJR047C 474 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 IME1YJR094C 1083 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 MOH1YBL049W 417 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 PNO1YOR145C 825 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 PEX1YKL197C 3132 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 DUN1YDL101C 1542 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN5Q12250 YDL071CYDL071C 375 nt3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms