Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms