Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00205P59089 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms