Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTNP21246 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTNP21246 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTNP21246 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTNP21246 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTNP21246 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTNP21246 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms