Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFLP07196 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFLP07196 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFLP07196 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFLP07196 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFLP07196 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFLP07196 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEFLP07196 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFLP07196 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms