Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms