Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASS4Q9NQ75 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms