Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms