Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS25Q9BRG1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms