RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324079.10

TDRP-201, Transcript of testis development related protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TDRP, Length 3,395 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRP-201ENST00000324079 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.54■■■□□ 2.96
TDRP-201ENST00000324079 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.47■■■□□ 2.47
TDRP-201ENST00000324079 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TDRP-201ENST00000324079 HRCP23327 699 aa30.1■■■□□ 2.41
TDRP-201ENST00000324079 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.95■■■□□ 2.39
TDRP-201ENST00000324079 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TDRP-201ENST00000324079 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.45■■■□□ 2.3
TDRP-201ENST00000324079 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.36■■■□□ 2.29
TDRP-201ENST00000324079 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.03■■■□□ 2.24
TDRP-201ENST00000324079 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.02■■■□□ 2.24
TDRP-201ENST00000324079 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.89■■■□□ 2.22
TDRP-201ENST00000324079 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TDRP-201ENST00000324079 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TDRP-201ENST00000324079 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TDRP-201ENST00000324079 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.48■■■□□ 2.15
TDRP-201ENST00000324079 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TDRP-201ENST00000324079 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.45■■■□□ 2.14
TDRP-201ENST00000324079 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TDRP-201ENST00000324079 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
TDRP-201ENST00000324079 NEUROD1Q13562 356 aa27.9■■■□□ 2.06
TDRP-201ENST00000324079 TRIM41Q8WV44 630 aa27.82■■■□□ 2.04
TDRP-201ENST00000324079 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TDRP-201ENST00000324079 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.81■■■□□ 2.04
TDRP-201ENST00000324079 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TDRP-201ENST00000324079 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
TDRP-201ENST00000324079 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
TDRP-201ENST00000324079 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TDRP-201ENST00000324079 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TDRP-201ENST00000324079 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TDRP-201ENST00000324079 MYT1Q01538 1121 aa27.4■■□□□ 1.98
TDRP-201ENST00000324079 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TDRP-201ENST00000324079 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.95■■□□□ 1.9
TDRP-201ENST00000324079 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TDRP-201ENST00000324079 MIER1Q8N108 512 aa26.87■■□□□ 1.89
TDRP-201ENST00000324079 ABCC9O60706 1549 aa26.87■■□□□ 1.89
TDRP-201ENST00000324079 SCRIBQ14160 1630 aa26.76■■□□□ 1.87
TDRP-201ENST00000324079 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TDRP-201ENST00000324079 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TDRP-201ENST00000324079 NACADO15069 1562 aa26.54■■□□□ 1.84
TDRP-201ENST00000324079 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TDRP-201ENST00000324079 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.41■■□□□ 1.82
TDRP-201ENST00000324079 CEP162Q5TB80 1403 aa26.38■■□□□ 1.81
TDRP-201ENST00000324079 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TDRP-201ENST00000324079 BCANQ96GW7 911 aa26.29■■□□□ 1.8
TDRP-201ENST00000324079 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.24■■□□□ 1.79
TDRP-201ENST00000324079 ABCC8Q09428 1581 aa26.18■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.17■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 SOGA1O94964 1423 aa26.17■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.17■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 WIZO95785 1651 aa26.17■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 BCL11AQ9H165 835 aa26.15■■□□□ 1.78
TDRP-201ENST00000324079 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.14■■□□□ 1.77
TDRP-201ENST00000324079 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
TDRP-201ENST00000324079 APLP2Q06481 763 aa26.12■■□□□ 1.77
TDRP-201ENST00000324079 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.11■■□□□ 1.77
TDRP-201ENST00000324079 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.02■■□□□ 1.76
TDRP-201ENST00000324079 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.02■■□□□ 1.76
TDRP-201ENST00000324079 KCNH8Q96L42 1107 aa25.96■■□□□ 1.75
TDRP-201ENST00000324079 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.88■■□□□ 1.73
TDRP-201ENST00000324079 FKBP8Q14318 412 aa25.87■■□□□ 1.73
TDRP-201ENST00000324079 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TDRP-201ENST00000324079 ITGAEP38570 1179 aa25.86■■□□□ 1.73
TDRP-201ENST00000324079 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
TDRP-201ENST00000324079 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.79■■□□□ 1.72
TDRP-201ENST00000324079 GOLGA3Q08378 1498 aa25.75■■□□□ 1.71
TDRP-201ENST00000324079 CLIP1P30622 1438 aa25.72■■□□□ 1.71
TDRP-201ENST00000324079 NEFLP07196 543 aa25.65■■□□□ 1.7
TDRP-201ENST00000324079 SMARCA4P51532 1647 aa25.62■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 TRIM52Q96A61 297 aa25.62■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TDRP-201ENST00000324079 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TDRP-201ENST00000324079 EEA1Q15075 1411 aa25.55■■□□□ 1.68
TDRP-201ENST00000324079 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.52■■□□□ 1.68
TDRP-201ENST00000324079 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TDRP-201ENST00000324079 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.47■■□□□ 1.67
TDRP-201ENST00000324079 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.46■■□□□ 1.67
TDRP-201ENST00000324079 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TDRP-201ENST00000324079 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.44■■□□□ 1.66
TDRP-201ENST00000324079 SMARCA2P51531 1590 aa25.42■■□□□ 1.66
TDRP-201ENST00000324079 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.37■■□□□ 1.65
TDRP-201ENST00000324079 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.36■■□□□ 1.65
TDRP-201ENST00000324079 MSH5O43196 834 aa25.34■■□□□ 1.65
TDRP-201ENST00000324079 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.31■■□□□ 1.64
TDRP-201ENST00000324079 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
TDRP-201ENST00000324079 KIF21BO75037 1637 aa25.22■■□□□ 1.63
TDRP-201ENST00000324079 ANP32CO43423 234 aa25.21■■□□□ 1.63
TDRP-201ENST00000324079 SYNJ1O43426 1573 aa25.15■■□□□ 1.62
TDRP-201ENST00000324079 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TDRP-201ENST00000324079 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TDRP-201ENST00000324079 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TDRP-201ENST00000324079 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
TDRP-201ENST00000324079 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.11■■□□□ 1.61
TDRP-201ENST00000324079 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
TDRP-201ENST00000324079 NBR1Q14596 966 aa25.04■■□□□ 1.6
TDRP-201ENST00000324079 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TDRP-201ENST00000324079 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TDRP-201ENST00000324079 WDR97A6NE52 1622 aa24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms