Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms