Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms