Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP33Q8TEY7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP33Q8TEY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms