Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms