Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE1Q08AE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms