Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCAN1P53805 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms