Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms