Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2BP42772 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms