Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ITGAEP38570 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGAEP38570 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms