Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD10P28358 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms