Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE2O96020 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE2O96020 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms