Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.8 ms