Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms