Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK12Q9NYV4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms