Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms